Бельфор в 1350—1636 гг. принадлежал Австрии. Но по окончании раздиравшей Германию с 1618 по 1648 г. Тридцатилетней войны, в которой оказались замешаны многие европейские державы, Бельфором завладела Франция. В 1814 г. город выдержал долгую осаду австрийских войск и капитулировал только после отречения Наполеона. Вскоре в городе произошли события, ставшие главным эпизодом борьбы либералов против режима Реставрации. В конце 20-х гг. XIX в. но Франции возникло тайное революционное Общество карбонариев. Члены общества выступали против духа своекорыстия, охватившего страну, и ставили целью низвержение Людовика XVIII. Одним из руководителей карбонариев был неукротимый и деятельный генерал Лафайет. Офицеры крепости Бельфор при поддержке влиятельных карбонариев разработали план восстания и назначили его на 1 января 1822 г. Однако полиции удалось выследить и схватить заговорщиков.
Во время франко-прусской войны Бельфор умело защищал его комендант Данфер-Рошро, город сопротивлялся немцам около трех месяцев (в ноябре 1870 г.— феврале 1871 г.), что позволило ему остаться французским, когда по договору 1871 г. Эльзас отошел к Германии. В память об этой героической обороне скульптором Бартольди в скале высечен грандиозный монумент — Бельфорский лев (его уменьшенная копия установлена в Париже, на площади Данфер-Рошро).
Безансон, главный город департамента Ду и всего экономического района Франш-Конте, некогда был столицей племени секванов — одного из самых больших племен Бельгийской Галлии. Это племя получило название от пограничной между бельгами и кельтами реки Секвана (ныне река Сена). В 58 г. до н. э. в Безансон вступили войска Цезаря, а в IV в. он сделался столицей римской провинции Большая Секвана. В 456 г. город захватило племя бургундов, и он принадлежал Бургундии до 1032 г. В 1649 г. Безансон присоединили к Испании, у которой Людовик XIV его отвоевал в 1668 г. С 1678 г. Безансон — столица провинции Франш-Конте. В XVIII в. здесь обосновались швейцарские часовщики, от них местные жители и переняли тайны ремесла.