Атриум, или Большой салон первого этажа служит продолжением входного холла Музея. С первых шагов посетитель проникает в новую среду, знакомясь с экспозицией «Искусство Перламутра, священные раковины».

Справа от Атриума расположен огромный конференц-зал, оформление которого было выполнено в начале века. Здесь демонстрируются документальные фильмы о «Подводной одиссее Кусто» и другие фильмы морской тематики. В этом большом зале также проходят национальные и международные научные конференции.

С другой стороны первого этажа находится зал «зоологической океанографии», так называемый зал китов, который назван так в связи с тем, что в нем расположен 20-метровый скелет кита, выловленного в 1896 году у близлежащего итальянского берега. Хребет кита в центре экспозиции образует нечто вроде системы мачт. На экране под хребтом без остановки идет фильм о подвигах принца на морях. Благодаря этому создается эффект постоянного движения. Дополняет картину реконструкция лабораторной каюты, оборудованной когда-то на яхте «Ласточка-2», с раскиданными по столам рукописями, с батареями колб, в которых заспиртованы морские организмы, с разным научным инвентарем и, конечно, с восковыми фигурами Альберта, доктора Ришара, их помощников.

В этом зале также представлены скелеты кашалотов, касаток и нарвалов. Здесь можно ознакомиться с чучелами различных морских животных: акул, рыбы-пилы, черепах и гигантских крабов из Японии. Здесь есть даже электронная иллюстрация набора веса новорожденным китенком: навскидку он прибавляет примерно по 1 г в секунду.

Некоторые морские животные сделаны в виде муляжей, в частности, муляж латимерии, несколько особей которой были выловлены в Индийском океане и которая является дальним предком человека.